Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms