Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms