Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Nsmce3Q9CPR8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nsmce3Q9CPR8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nsmce3Q9CPR8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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