Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a6bQ99N09 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms