Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ciao1Q99KN2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms