Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms