Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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