Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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