Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cmc2Q8K199 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms