Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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