Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms