Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubash3bQ8BGG7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubash3bQ8BGG7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubash3bQ8BGG7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ubash3bQ8BGG7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ubash3bQ8BGG7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ubash3bQ8BGG7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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