Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed4Q80WQ9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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