Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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