Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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