Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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