Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atp8b3Q6UQ17 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atp8b3Q6UQ17 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atp8b3Q6UQ17 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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