Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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