Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot7Q60809 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnot7Q60809 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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