Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms