Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms