Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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