Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms