Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nom1Q3UFM5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nom1Q3UFM5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms