Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gse1Q3U3C9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gse1Q3U3C9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gse1Q3U3C9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gse1Q3U3C9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gse1Q3U3C9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gse1Q3U3C9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gse1Q3U3C9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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