Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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