Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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VgfQ0VGU4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VgfQ0VGU4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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