Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms