Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms