Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cacna1cQ01815 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms