Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms