Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Scn1bP97952 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Scn1bP97952 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Scn1bP97952 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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