Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NyxP83503 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NyxP83503 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NyxP83503 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NyxP83503 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NyxP83503 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms