Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Rps18P62270 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rps18P62270 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps18P62270 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms