Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp46P62069 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms