Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms