Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GferP56213 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GferP56213 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GferP56213 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms