Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TbpP29037 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TbpP29037 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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TbpP29037 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TbpP29037 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TbpP29037 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TbpP29037 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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