Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxrgP28705 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms