Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd10P28359 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms