Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Defa3P28310 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Defa3P28310 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Defa3P28310 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Defa3P28310 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms