Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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