Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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