Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms