Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LtaP09225 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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