Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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