Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Smarce1O54941 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarce1O54941 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarce1O54941 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarce1O54941 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarce1O54941 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarce1O54941 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarce1O54941 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarce1O54941 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarce1O54941 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarce1O54941 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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