Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
E2f6O54917 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
E2f6O54917 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms