Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Edil3O35474 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Edil3O35474 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms