Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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